Im Schuljahr 2006/2007 besuchen insgesamt 503 Schüler/innen, 131 Schüler/innen mit dem Förderschwerpunkt Lernen, 48 Schüler/innen in der Klinikschule, 12 Schüler/innen in den Aspergerklassen, 27 Schüler/innen in den Kleinklassen für Autisten und 21 Schüler/innen in den Berufsschulklassen des Förderschwerpunktes Lernen. Für Unterricht und Erziehung sind insgesamt 93 Lehrer/innen, davon 34 Sonderschullehrer/innen, 15 Studienrät/innen, 18 Erzieher/innen, 13 Schulhelfer/innen sowie drei Lehramtsanwärter/innen uständig.
Seit dem Schuljahr 2005/2006 ist die Comenius-Schule eine Verlässliche Halbtagsgrundschule (VHG). Den Schüler/innen der Klassen 1 bis 6 wird von 7.30 bis 13.30 Uhr ein verlässliches Bildungsangebot garantiert. Dazu stehen ihnen zusätzlich zu den Klassenzimmern zwei schuleigene Räume zur Verfügung, in denen freies und angeleitetes Spielen unter Obhut eines Erzieherteams während der Freistunden möglich ist, was bei allen sehr eliebt ist. Im Schuljahr 2006/07 benötigen ca. 160 Kinder eine ergänzende Betreuung über die Zeiten der VHG hinaus. Diese Betreuung wird von der Schule bereit gestellt, und von einem freien Träger organisiert und durchgeführt. In derzeit fünf Standorten, allesamt fußläufig von der Comenius-Schule entfernt, werden die Hortkinder bis maximal 18 Uhr von erfahrenen Erzieherteams betreut. Die Kinder der jüngeren Jahrgänge besuchen überwiegend die neu eingerichtete Villa Comenius. Dieser Hortstandort mit Garten ist der Schule zu Beginn des Schuljahres 2005/06 vom Schulamt zurVerfügung gestellt worden. Wie auch in den anderen vier Einrichtungen des Hortverbunds Villa Comenius (ViCo) wird das Essen frisch zubereitet.